Η σύγχρονη γεωργία ανατρέχει συχνά σε μοριακές μελέτες για την κατανόηση της αλληλεπίδρασης μεταξύ φυτών και παρασίτων, προκειμένου να τα εξαλείψει. Μία χρηματοδοτούμενη από την ΕΕ προσπάθεια χρησιμοποιεί την πρωτεομική για την οριοθέτηση της διαδικασίας μόλυνσης των φυτών τομάτας από το βακτήριο Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (CMM).
Αναλυτικά: http://cordis.europa.eu/fetch?CALLER=OFFR_TM_EN&ACTION=D&RCN=9804