Σε κράτη μέλη της ΕΕ (62,8%) και τις χώρες των Δυτικών Βαλκανίων (24,4%) κινήθηκαν οι εξαγωγές της πΓΔΜ το 2012, ενώ οι εισαγωγές της προήλθαν κυρίως από τα κράτη μέλη της ΕΕ (58,4%) και τις αναπτυσσόμενες χώρες (22,9%).
Οι σημαντικότεροι εμπορικοί εταίροι της πΓΔΜ είναι η Γερμανία, η Ελλάδα, η Σερβία, η Βουλγαρία και η Ιταλία, ενώ το εμπόριο με τις χώρες αυτές αντιστοιχεί στο 47,1% του συνολικού εξωτερικού εμπορίου της πΓΔΜ, συμφωνα με ενημερωτικό σημείωμα για την οικονομία της ΠΓΔΜ το 2012 του γραφείου Οικονομικών και Εμπορικών Υποθέσεων στα Σκόπια.